壳寡糖中含有某些氨基酸，且链长较短，因此具有较好的溶解性。壳寡糖生产与壳聚糖比较，壳寡糖苦味更小，并且有粉状和液态两种方式。壳寡糖广泛应用于食品、饮料、化妆品、废水处理等职业。壳寡糖是一种环保型的农业原料，可用于制造化肥、杀菌剂等。
壳寡糖不能直接使病毒失活，但关于植物体内病毒的仿制和长距离移动具有明显的抑制效果，壳寡糖生产经过抑制植物间病毒和类病毒的传达，进步宿主对感染的过敏性反应，从而到达操控植物病毒性疾病的效果。病毒发生前运用，可预防病毒病发生，能诱导植物对病毒增殖和体内长距离移动的抵抗性，且其诱导活性不依赖寄主的R基因，病毒迸发后运用，可抑制病毒向重生叶片的传达。关于真菌的效果广谱，简直对所有的真菌病害都有不同程度的预防效果，包含白粉病、霜霉病、黑痣病、立枯病等，与靶向性杀菌剂混配，如烯酰吗啉、氟硅唑、吡唑醚菌酯、噻呋酰胺、乙蒜素、戊唑醇、氰烯菌酯等，可完成表里统筹，到达减药增效的效果。
在农业生产过程中，外界环境的急剧改变会对植物产生巨大的不可逆伤害。壳寡糖生产在北方大棚区及早春露地作物上低温冻害经常发生，天气反常时，南边的柑橘、葡萄等也会出现冻害或冷害，发生苗弱、叶片萎蔫、落花落果、果实变形等，地温低也让根系的吸收能力下降，光合效率低下，直接影响作物产量和品质。如低温环境易导致植物细胞膜流动性下降以及过氧化，对植物细胞形成伤害，壳寡糖可进步可溶性蛋白和可溶性糖等抗寒性物质的含量，下降膜脂过氧化水平缓膜透性的添加程度，保持作物较高的光合强度，有效抵挡低温对作物的伤害。三浦百草张剑波试验表明，壳寡糖在诱导植物抗寒方面效果显著，提早1~7天运用效果显著。此外，经过在高温环境下的菠菜试验，张剑波发现喷施500倍百净（3%氨基寡糖素）的菠菜叶片受损害的程度远远低于对照，说明壳寡糖对植物的抗热、耐热能力效果明显，壳寡糖的抗热特性为在高温季节运用壳寡糖的含义严重。
壳寡糖在植物细胞和组织中具有抗菌、诱导植物生产甲壳素酶的效果，壳寡糖生产并可进步酶活性，促进蛋白质组成，调理植物基因的封闭和敞开，诱导成长素吲哚乙酸（IAA）的组成。影响植物多种成长发育基因，组成利于植物成长的生物活性物质，活化植物细胞、促进植物的快速成长和发育。
